首先描述英国科学家Sir George G. Stokes于1852年,是负责这一术语时,他观察到的矿物萤石发出红光,当它被照亮的紫外线激发荧光。斯托克斯指出,总是发生在比激发光的波长更长的荧光发射。在19世纪早期的调查表明,当用紫外线照射时,许多标本(包括矿物,晶体,树脂,生药,黄油,叶绿素,维生素,和无机化合物)荧光。然而,直到20世纪30年代开始使用荧光染料染色的组织成分,细菌和其他病原体的生物调查。几个这些污渍具有较高的特异性,刺激的荧光显微镜的发展。
在图1所示的是一个现代的两个发射和反射荧光显微镜落射荧光显微镜的剖面图。在该图的中心的垂直照明器具有在其一端(标记的落射灯箱)和过滤器立方体炮塔的另一位置的光源。该设计包括一个基本的显微镜,其中反射光的反射光的波长长于激发。Johan S. Ploem入账垂直照明反射光荧光显微镜的发展。在荧光垂直照明,光的特定波长(或定义的波长带),经常在紫外,蓝色或绿色区域的可见光谱,通过来自光源的电弧放电灯或其他源通过一个多光谱激发波长选择性的过滤器。通过激发光滤光片的波长反映从一个二色反射镜或分束器(也称为二向色性)的表面上,通过显微镜的物镜浴中的试样强烈的光线。如果样品发出荧光,通过由物镜聚集的发射光通过二色镜,随后过滤通过一个势垒(或发射)滤波器,该滤波器阻止不需要的激发波长。重要的是要注意,荧光试样,激发后,产生自己的光在光学显微镜下是唯一的模式。所发出的光在所有方向上,球的再辐射的激发光源方向无关。